東華高教深耕計畫從『全球視野、在地深耕』的精神，以基底建構、優化品質、深化連結、拓展視野等發展四項計畫主軸：教學創新、公共辦學、生根花蓮、揚帆國際，從軟、硬體設施的學習環境整備、創新思考的學習內容創建、師生的學習社群活動到產學的學習實踐應用，規劃七項分項計畫，希冀協助校內教師精進教學技巧，引導學生自主學習，強化東華與花蓮人文特色、社區、產業、連結，讓學習從在地深耕做起，實踐由全球視野出發。
圖一、東華深耕計畫理念與架構圖
本計畫以本校中長程發展計畫為基礎，規劃各項計畫內容，而各分項計畫將由本校行政與教學單位，依據其特性執行計畫內容，藉由行政單位全力支持、學術單位全面投入，發揮行政單位之能量、連結學術單位之專業，帶領東華師生達到本計畫核心理念：創新跨域教學、深耕在地實踐。為了考核各項計畫執行進度，本校將設置總計畫，由校長擔任主持人，綜整深耕計畫整體事務，整體計畫執行管考機制請見下圖。
圖二、東華深耕計畫管考機制圖