本校獲教育部高等教育深耕計畫各獲得約4.1億元經費，包含四個特色領域研究中心補助(分別為太空科學與科技研究中心、高能與強場物理研究中心、地震災害鏈風險評估及管理中心和新世代光驅動電池模組研究中心)，以及三個大學社會責任實踐計畫(「桃海三生」深耕型計畫、「部落書香學堂」萌芽型計畫及「雙連陂社區文化保存與提升居民健康」種子型計畫)；做為本校未來推動教學創新與學術拔尖重要挹注資源。本校高等教育深耕計畫整體規劃如下：
一、「落實教學創新及提升教學品質」：本校推動教學精進行之有年，以「博雅專精」為願景，致力於培養學生「自主學習」、「跨域合作」、「社會實踐」、「國際移動」四大能力。為落實教學創新，本校提出了NCU 2022的教學願景，內含七大執行策略，以呼應未來的教育趨勢，整體推動架構如下圖所示。
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二、「發展學校特色」：本校為全國最早提出以「永續發展」(Sustainable Development)作為教學和發展總目標的學校，104年本校擬定「深具人文關懷的世界一流大學」為發展願景，並訂定「兼顧博雅專精」、「培養領導人才」、「引領知識創新」、「追求學術卓越」、「永續社會發展」、「增進人類福祉」等六大辦學目標，深化人文素養與科技發展之結合，增強本校學研環境建構與能量整合，期以對應「聯合國永續發展目標(SDGs)」，推動經濟、社會和環境發展之平衡，促進永續發展的實現。為能聚焦特色發展，實現本校發展願景與辦學目標，本校以「永續發展」為核心，檢視發展現況、優勢與問題，制定本校「發展學校特色」推動策略架構如下圖所示：
三、「提升高教公共性」：本校在入學端及經濟端提供必要的協助，讓弱勢生可以安心就學，並針對個人狀況提供客製化的學習輔導，讓同學得以順利完成學業。此 外，提升本校校務治理的功能，將辦學相關資訊公開分享給社會大眾，藉此與社會大眾產生雙向溝通，也是提升高教公共性的重要一環，因此，本校也將持續強化校務研究辦公室的功能，發揮以證據為本的校務創新精神，從大數據與統計分析出發，改善學校的體質與人力結構，並據以調整招生的策略與方法，達成適性揚才的目標。
四、「善盡大學社會責任」：本校將結合自我定位及特色，藉由校務研究、教學創新、學校行政、教師實踐研究等配套，並提出四大社會責任計畫作為執行方案，以實現「在地環境永續」、「在地文化永續」及「在地社會及經濟永續」之社會目標。為達成上述目標，本校履行社會責任的策略與作法包括三方面：深化校內支持系統、加強區域鏈結協助在地產業發展，以及推動社會責任計畫解決在地問題與困境。
五、「聚焦特色學院及特色領域，延續尖端學術成果」：將聚焦具國際競爭之「永續地球環境特色學院」及「智慧系統-關懷科技特色領域」，分從教學、研究，以及產學合作等面向鏈結全球發展，形成具特色及國際競爭之前沿技術與研發能量，解決產業需求、國家重大議題或重點產業技術開發，提升國際競爭力。
六、「整合優勢領域，打造特色研究中心」：本校整合校內原有之優秀研究團隊，規劃有「太空科學與科技研究中心」、「高能與強場物理研究中心」、「地震災害鏈風險評估及管理研究中心」、「新世代光驅動電池模組研究中心」共4個特色領域研究中心，除提升既有的研究能量外，未來更以「培育優秀人才」、「研究/技術提升與開拓」、「產業新興趨勢之創造」為目標，期能吸引國際一流學者與國際優秀學生進行學術交流，以及參與國外名校、研究機構與企業之研究合作或技術開發，以提升本校之國際影響力，打造國家級人才聚落及研究中心，並擔任國家解決重大議題之智庫。
