本校所提「深耕計畫」是在現有的優異辦學基礎上，根據本校中長程計畫中既定的校務發展計畫策略，依照「一、落實教學創新及提升教學品質；二、發展學校特色；三、提高高教公共性；與四、善盡大學社會責任」等四大面向，進行現況的分析與問題檢討，並具體條列了推動的目標、策略及執行方案。國立清華大學將繼續在「深耕計畫」的支持下，從臺灣頂尖大學到世界一流大學、實現全人教育理想、發展研究重鎮、加強社會連結與服務，以落實本校中長程計畫中「人文薈萃學術殿堂、博雅專業人才搖籃、前瞻創新科技重鎮、進步社會推動基地」的發展願景與目標。