本校107 年計畫執行榮獲外部肯定之亮點成果，摘要如下：
1. 董事會支持辦學，相對提撥本校高教深耕計畫(含附錄及 USR 計畫)獲核定總金額 20%之特別預算，支持計畫推動。在學生輔導、 就學獎補助、國際化等部分充分利用慈濟的豐沛資源，發揮學校培育人才的特色。
2. 成立「慈濟校院-中研合作研究平台」，由本校、慈濟醫療志業及中研院三方合作成立研究團隊，並獲慈濟醫療法人挹注二億元經 費支持計畫進行。
3.遠見雜誌 2018 台灣最佳大學排行榜，本校獲醫科第 6、私立大學第 9、教學表現第12、生師比第 5、學生平均經費第 8，年度增 加經費第 5。
4.107 年度上半年第二週期校務評鑑四個項目全數通過、醫學系TMAC 評鑑全面通過(評鑑有效期限 6 年)、「107 年度教育部大專校 院特殊教育、學輔經費及性別平等教育業務書面審查」初審全數通過。
5.獲 2018「行政院國家永續發展獎」；2018 年「世界綠能大學排名」第 155 名。
6.成立國際暨跨領域學院，107 學年國際生占比達 10.85%，獲教育部 107 年度境外學生輔導工作「績優學校」及「績優人員」雙肯 定。
7.教育部教學實踐研究計畫，共通過 14 件(生技醫護學門 6 件、社會學門 1 件、教育學門 5 件、通識學門 2 件)，通過率 70%，高於 全國一般大學平均通過率(52%)。
8.「人文飄香：靜思茶道」及「現代柯南之跟著瑪斯一起探索檢驗世界」課程，榮獲教育部「磨課師標竿課程獎」。
9.醫學與人文結合之模擬醫學課程及無語大體老師教學，獲韓國 KBS 電視製作專題節目及大陸人民日報專文報導。
10.學生學習成效表現充分展現本校「專業加值、人文利他」辦學特色及成效。
(1)醫師、中醫師、護理師、醫檢師、物理治療師、社工師、中等學校教師專業證照國考通過率持續優於全國平均通過率。
(2)參與校外競賽獲獎：「107 年教育部師資培育大學新課綱教案暨教學媒體設計競賽」教案組特優 1 件、教案組佳作 2 件、教案 組入選 1 件及教學媒體組入選 1 件；「拜耳創新獎」中華區總裁特別獎 1 人；「國家衛生研究院精準醫療暑期實習」實習優良 獎2 人；僑委會及海華文教基金會第 3 屆「蹲點僑世界」影片競賽佳作獎 2 件。
(3)文創觀光 USR 計畫課群學生為花蓮旅遊打造專屬的 APP 及網站平台，將進駐花蓮火車站或花蓮縣遊客服務中心設置導覽櫃台 進行創意導覽解說。