本期高等教育深耕計畫，國立臺灣大學（以下簡稱本校）以日本京都大學為五年內短中程競逐目標、美國加州大學洛杉磯分校（UCLA）為未來長程標竿學校。透過校務研究分析梳理與京都大學之差異，從而訂定博士人才培育、研究能量永續與突破、基礎研究設施強化、國際研究連結等標竿競逐策略，具體執行。
一、 博士人才培育：
少子化現象已衝擊本校博士班學生人數，影響研究動能，不利標竿競逐。因應此趨勢，104學年起推動「逕行修讀博士學位學生研究提升計畫」，吸引本校優秀學生直攻博士學位。107年起擴大執行本方案，補助名額由原訂60名增加至100名，在政策積極鼓勵下，逕博人數於108學年度第一學期更達125名，107-108年兩年合計217名。
二、 研究能量永續與突破：
本校以種子經費概念推動團隊型「核心研究群計畫」，由本校資深傑出教師擔任總主持人，團隊成員含三分之一以上年輕教師，共同推動新穎性研究課題，傳承、永續研究能量。另推動個人型「拾玉計畫」、「深耕計畫」、「桂冠計畫」，分別鼓勵研究動能面臨短期困境、具新穎研究議題、研究表現傑出之年輕教師，孜孜不倦積極突破。推動至今，已組成41個核心群團隊，累計挹注百件以上個人型計畫，並注重人社領域之平衡發展。本校論文引用於2019年達87萬次，較2018年成長13%；近十年高被引論文達649篇，較2018年增加38篇；前10%高被引論文比例於2019年成長15%，已逐步追上京都大學；另本校共計13名高被引學者。相關研究策略推動已收初步成效。
三、 基礎研究設施強化：
為提升本校教師之研究臨界突破能量，成立由質譜學、分子影像學、電子顯微學、半導體製程學等高門檻研究技術構成之「國立臺灣大學重點技術平台」。由專業教授群、技術專家搭配尖端核心設施，組成專家系統，建構橫跨基礎分析服務與進階問題解決的專業平台，以新興技術發展、進階技術訓練、多元研究服務三大軸向，提供關鍵研究服務，推行至今成效卓著，成果發表於Science19’、Nat. Commun.18’ & 19’等期刊。本平台與日本文科省「先端研究基盤共用促進事業」貼合，緊扣國際研究趨勢脈動。
四、 策略重點姊妹校旗艦計畫與國際生入學機制改善：
本校成立策略重點姊妹校旗艦補助計畫，鼓勵成立跨領域國際研究團隊。108年旗艦計畫補助本校19個國際研究團隊，成員包含校內兩系以上及國外合作學校三所以上之教研人員，研究主題涵蓋1項以上Sustainable Development Goals（SDGs），以主題式合作引入國際團隊共同研究現今社會問題。透過國際生招生提前措施及國際生獎學金增額機制等方案，提高入學報到率，同時本校成立專責境外生招生團隊，整合招生及入學等業務，並於海外舉辦入學說明會、主辦科學營等多項創新規劃，以提升境外生質量。