輔仁大學高教深耕計畫以「FJCU的跨越、超越、卓越」為目標，整體目標為將本校打造成為「在地深耕」、「永續發展」、「邁向國際」的塭仔圳永續創新大學城。以創新為基礎，從校園內部推動永續發展，與周邊鄰里合作，打破輔大地理位置與圍牆校園之限制，成為在地大學城。
本校114年度高等教育深耕計畫整體亮點：
1.全臺唯一融合資訊科技與人文關懷的宗座大學
本校持續發揚宗座大學的人文底蘊，以具備G.R.A.C.E.精神的教育理念為核心，積極引導傳統人文、藝術與語文領域深化與資訊科技的融合應用。
藝術學院在數位教學上取得實質突破，應美系教師榮獲2025美國戴維獎（Davey Awards）最佳動畫應用銀獎，展現國際專業設計實力。學院課程深度整合AI繪圖、AR擴增實境、Luma 3D建模、空拍機、以及AI音樂生成等技術，共同打造虛實融合的「數位藝境」沉浸式體驗，並規劃未來建置VR校園生活館。
本校將AI應用於人文地景與文化推廣，例如：文學院開設「民間文學與互動式AI敘事」課程；外語學院學生運用Dify平台開發「翻譯報價機器人」並承接企業翻譯案；日文系學生開發AI LINE Bot 進行語言練習與創造力培養。校務研究數據顯示，修讀融入資訊科技與人文關懷課程的學生，在資訊科技應用和創新等共通職能上的平均認同度有顯著提升。
成功加入TAICA人工智慧聯盟AI學分學程，培訓7名非資訊相關類科教師取得AI相關證照後開設4場工作坊，分享自身結合AI與專業領域的經驗。本年度完成AI跨領域課程模組盤點，啟動課程整合機制。
2.創新跨領域教學，培養產業所需優質人才
本校將教學重點從「開設多元課程」提升至「產學成果導向、實戰驗證」模式，確保學生具備面對數位時代挑戰的跨域競爭力，並在國內外頂尖競賽中屢獲佳績。
師生新創團隊以《AI職能治療智慧輔助系統》在2025全國大專校院智慧創新暨跨域整合創作競賽中榮獲「體感互動科技組」第一名及「跨域整合特別獎」雙項殊榮。此外，在2025資訊應用服務創新競賽中，學生團隊榮獲「商業發展治理組」第一名以及資訊應用組第三名。
校務研究數據顯示，修讀過產學成果導向課程或創新課程的畢業生，對其科系與工作相符程度以及能力與工作相符程度的平均認同度，皆顯著高於未修讀者，有助於縮短尋找第一份工作的時間。
3.跨領域教學創新精進，深化永續、數位與設計思維
本校已將永續發展目標（SDGs）、設計思考（DT）與數位素養視為跨領域教學的核心，並透過校級研究中心整合資源，推動前瞻性學術探討。
開設ESG專業證照課程，培育碳盤查種子學生數達成率達220%，並實際應用於校園永續實踐。學生修讀融入永續意涵課程後，在永續知覺、永續思考、跨域合作等能力上有顯著提升。
創意設計中心作為教育部苗圃計畫的延伸，積極開發 Design Thinking + AI 備課RAG系統，並完成多套設計思考化教學模組，推廣ESG服務學習結合AI的教學方法。
正式確立永續發展、大健康、AI與科技數據、人文與社會責任四大校級研究中心，並首度推動與澳洲西雪梨大學、越南胡志明市經濟大學的跨國合作研究專案。法律學院與輔大醫院跨域合作，共同研究人工智慧運用於醫療行為之刑事法問題，前瞻性地探討AI供應者、營運者和使用者的法律責任。
4.結合G.R.A.C.E.治校理念，打造在地與國際化兼具的永續大學城
本校持續強化國際移動力與在地社會責任，建立獨特且全面的國際化支援體系，實現「在地化與國際化兼具的永續大學城」目標。
以「國際化行政支持系統專章」經費在校內重要行政單位提供多語種駐點服務，顯著提升境外生的校園適應力與行政溝通效率。
本校組織海外服務學習團隊前往越南、坦尚尼亞、印度、蒙古等地，執行涵蓋永續環保、AI資訊素養、健康衛教、中文教學等多領域的SDGs服務方案。在地的「學童安全行動方案」則將AI教育與網路安全融入對新莊在地學童的服務學習課程中。
織品服裝學院將永續時尚設計帶至匈牙利GSFW永續時尚週展演。外語教學與數位學習資源中心新增Global General日常外語平台，提供英、西、法、德、義、葡6項歐語學習資源，為全台大專院校獨有之語言學習資源平台。藝術學院學生在國際競賽 Indie Film Music Contest 中獲得第一名與第三名。