第一階段(112-113年)高等教育深耕計畫，國立臺灣大學（以下簡稱本校）以日本東京大學為五年內短中程競逐目標、美國加州大學洛杉磯分校（UCLA）為未來長程標竿學校。以校務研究分析本校與標竿學校之差異，於前瞻研究、人才培育及國際合作等面向擬定並具體執行追趕標竿學校各項推動措施。
一、深化重點姊妹校合作，成立三校國際聯合研發中心
本校深化京都大學、東京大學、筑波大學、伊利諾大學香檳分校(UIUC)、漢堡大學、雪梨大學、康乃爾大學、西北大學、羅徹斯特大學、漢堡大學、科諾伯勒阿爾卑斯大學(UGA)及臺拉維夫大學等姊妹校之合作，112-113年補助28件國際合作種子計畫/合作項目，並設立「臺大+九州大學+UIUC」、「臺大+筑波大學+UGA」三校國際聯合研發中心，拓展國際連結。
二、建構特色領域國際研究中心，推動並整合跨域研究計畫
強化攬才留才措施，推動「延攬人才研究補助」、「跨領域種子計畫」及「擴充加值國際合作計畫」，共支持100個跨領域研究團隊及超過200件個人型計畫，並與超過40個國際學術單位進行合作，設立2個國際聯合實驗室，和2個國際聯合研發中心。本校近五年每師論文被引用數逐年增加至182次，相較於2021年之165次增加10%，近十年高被引論文增加至838篇，2024年11月所發布THE跨域科學大學排名為全球第21名，達具體成效。
三、推動貴重儀器補助，建置公開服務及個人尖端研究設施
以前期國立臺灣大學重點技術平台為根基，推動貴重儀器補助及委員會，補助公開服務型及潛力績優個人貴重尖端研究設備，支持跨學院之尖端研究設備包含冷原子光晶格系統、超解析原位空間多基因影像擷取儀等前沿設備。
四、發展臺大亞洲高等研究院暨全球永續發展智庫
成立余英時國際漢學研究中心、NVIDIA-臺大人工智慧聯合研究中心及企業法制創新研究中心，搭建跨領域頂尖交流平台。針對永續發展議題，舉辦「椰林講座」及「宋恭源先生頂尖研究講座」，邀請三位諾貝爾獎得主及多位國內外大學校長、院士及重量級學者參與，提升全球重要議題的影響力。
五、推動臺大國際引路人計畫及海外企業實習計畫
境外招生每年申請人數穩定成長，113學年度國際學位生申請人數達1,438人，較前一年成長16.34%，為歷年新高。「跨領域實習-臺灣引路人計畫」113年有70餘家企業參與，媒合298名學生。海外企業實習「引水人計畫」112年媒合31名學生至5國11機構，113年增至68人赴14國29機構。規劃推動國際人才培育方案NTU Beyond Borders提升學生全球移動力，2024年11月所發布THE全球就業大學排名為全球第79名。