第二期高教深耕計畫，學校以「建構培育跨域、跨界多元人才之永續大學」為總體目標，含括「教學創新、社會責任、產學連結、高教公共性、校務研究」五大面向，並以永續發展目標為指引，整合計畫各項主軸，持續實踐「社會責任、經濟發展、全球夥伴、生態環境」四大永續目標。更落實利害關係人議合、鑑別重大性議題，以利學校推動各項計畫、永續發展。
113年除持續深化五大面向之計畫內容外，因應「發展學校特色優勢、呼應SDGs精神」之核心論述，各計畫面向基於強調培養學生具備關鍵能力以面對未來世界，相對聚焦啟動五項具體重點推動策略，包含「從關鍵力加值到跨域特色人才培育」、「從行動學習到自主學習」、「從韌性校園到永續大學」、「建構大學社會責任孵化與拔尖制度」、「從平行到交集深化產學合作機制」，此五項策略亦作為第二期第二階段(114-116年度)計畫推展之開端。
為呈現本校各年度計畫成果，設置東吳高教深耕計畫網站(https://sprout.scu.edu.tw/)，並於網站中呈現歷年成果展亮點成果(https://sprout.scu.edu.tw/?page_id=248)。
