本校深耕計畫在「教學創新精進」、「提升高教公共性」、「產學合作連結」與「善盡社會責任」之目標為主幹，並以此概念下衍生出「優化校園學習環境」、「實踐跨域創新教學」、「營造雙語國際校園」、「善盡大學社會責任」、「智慧醫療靈性照護」、「發展優質新創育才」與「建構永續校園生活」之七大脈絡，藉此迎合社會趨勢脈動及戰略新創產業需求，進行教學創新與翻轉，引發學生學習熱情並以學生為主體執行教學實踐，提升自主學習能力、彈性自主學習時間以及樂於學習的友善校園。
本校 112 年度「高等教育深耕計畫」主冊獲 107,901,179 元補助，較去年增加1200萬元，不僅再創本校歷史新高，成長幅度高達12 %。附錄一就學協助 (原弱勢協助)獲 7,365,000 元，附錄二原民生輔導 (含本部及原民會補助) 1,670,000 元、公共性檢核 500,000 元之重要成果，因篇幅有限，餘請詳見本校「高教深耕計畫」 網站。
本校112年度「高等教育深耕計畫」整體亮點：
- 優化校園學習場域，打造國際化永續學習環境
透過高教深耕計畫，本校持續改善校園實體學習場域、優化線上學習平台，提高學生求學動機與精進學生學習成效。除此之外，本校設置多國語言國際角，打造國際交流環境，並且透過線上教學平台，提供國際職場技能，強化學生國際移動競爭力。
2.成立「永續發展暨校務研究中心」，專門規劃與推動永續發展事務，宣示本校實踐永續事務的決心。協調校內行政與學術單位，規劃、推動本校SDGs永續發展目標的各項議題，培育社會所需之永續領袖人才，呼應社會與企業需求，攜手產官學社，建立碳管理的整合性服務鏈，與合作夥伴一同邁進零碳排社會。
3.以輔大醫院做為塭仔圳發展的核心、帶動新五泰產業新動脈
輔大醫院於2023年升格為區域醫院，並且坐落於塭仔圳重劃區之中，將為此區提供重要的醫療能量。本校創意設計中心以「健康照護」與「醫療」為軸心，透過「設計思維」解決人類身心所面臨之痛楚，藉由創新技術發展具輔大獨具「特色醫療」，研發各項專利並與應用在產業實務，從「智慧醫療」與「精準健康」的角度，帶動台灣產業轉型朝向知識密集型產業邁進。
4.強化在地社區互動、發揮輔大社會影響力
身為天主教大學，人文關懷與社會服務之理念為本校教育重點，SDGs納入課程大綱，本校課程與SDGs對接，並且由本校USR中心的「輔仁好學‧好(ㄏㄠˋ) 學新莊」、「復原力：惜食分享 共生新莊」、「樂價都原」與「新莊郡全年齡康健療育」等計畫，深入了解鄰近社區特色與所面臨之痛點後，提供合宜解決方案，達到社區共融發展之目標。