第二期高教深耕計畫，學校以「建構培育跨域、跨界多元人才之永續大學」為總體目標，含括「教學創新、社會責任、產學連結、高教公共性、校務研究」五大面向，並以永續發展目標為指引，整合計畫各項主軸，持續實踐「社會責任、經濟發展、全球夥伴、生態環境」四大永續目標。更落實利害關係人議合、鑑別重大性議題，以利學校推動各項計畫、永續發展。
112年起因應國內外發展趨勢，總整未來人才所需關鍵能力以「自主學習、資訊科技與人文關懷、跨領域、問題解決、國際移動、社會參與」為其重點。據此，本校第二期第一階段推動「智慧創新x STEAM跨域數位人才培育」、「突破單一學科限制，推動跨域彈性學制」、「完善主冊國際化方案與國際專章連結之行政支持系統」、「打造全方位韌性智能校園」四大策略，與發展五大面向計畫內容。
為呈現本校各年度計畫成果，設置東吳高教深耕計畫網站(https://sprout.scu.edu.tw/)，並於網站中呈現歷年成果展亮點成果(https://sprout.scu.edu.tw/?page_id=248)。
